سیستم عامل لینوکس شهرت خود را از امنیتی که دارد به دست آورده است، لینوکس معمولا در برابر تهدیداتی که بر روی سیستم عامل ویندوز آسیب می رسانند آسیب پذیر نیست. البته بیشتر امنیت لینوکس به دلیل این است که تعداد نسبتا کمی از سیستم ها از لینوکس استفاده می کنند. اما بر اساس گزارش های منتشر شده تمرکز هکرها روی سیستم عامل لینوکس بیشتر از گذشته شده است. محققان امنیتی در شرکت هایی مانند کسپرسکی و بلک بری، همراه با سازمان هایی مانند FBI و NSA در مورد افزایش سازندگان بد افزارها بر روی سیستم عامل لینوکس هشدار داده اند.
در یک سال گذشته تهدیدهای مختلفی کشف شده است. برخی از آن ها برافزارهای شناخته شده ی ویندوز هستند که به لینوکس منتقل شده اند، در حالی که برخی دیگر تقریبا یک دهه است که بر روی سرورها بودند که شناسایی نشده بودند. این موضوع گویای آن است که تیم های امنیتی این خطرات را کم اهمیت می دانستند.
منبع arpaco